实验室依托上海师范大学，学校给予足够的研究场所和岗位编制及运行经费，学校科技处负责实验室建设的落实。
实验室实行主任负责，学术委员会监督制，由实验室主任、副主任及专职秘书等组成重点实验室管理小组，保障重点实验室各项工作顺利进行。主要任务包括：负责实验室发展规划并实施学术委员会通过的各项决策；认真听取各位课题组长的建议并及时给予反馈；制订与完善各项管理与规章制度；决定每年学术年会召开的时间与会议程序；负责仪器平台运行管理；科研与研究生事务。学术委员会对实验室的总体发展规划、科研方向、科研经费的使用提出指导性建议和监督。
学术交流：（1）每年召开所有学术骨干参加的学术交流年会，交流研究工作，向学术委员会汇报研究工作进展，听取学术委员会专家的建议；（2）每月邀请国内外专家到实验室作学术报告以及合作交流；（3）每月2次实验室内部青年骨干的常态化学术交流。
各课题组定期向主任汇报学术成果和科研成果， 并由重点实验室专人负责汇总，完成上海市科委对重点实验室年度考核。
重点实验室的学生由各课题组的研究生导师负责。